故事发生在遥远的2061年,网络成为了维系社会平衡不可或缺的存在,并且已经发展到了凭借意识就能够自由连结的地步,然而,网络的极度发达带来的却是个人信息的不断泄露和被篡改,并且因此而引发了一系列严重的社会问题,犯罪事件频发。为了保护个人隐私和安全,一个名为“Meta Real Network”的新型网络空间被发明了出来,在那里,名为“Bubble Shell”的防火墙保护着人类的记忆不受侵犯,然而,在这绝对安全的空间里,却有一批犯罪分子利用网络空间的漏洞进行着全新模式的犯罪,为了将这些罪犯捉拿归案,名为“
宇宙中一个超级黑洞,正在向塞博特恩袭来。但是,没有任何对抗这个黑洞的手段,塞博特恩只有被消灭的命运。就在这个时候,一个叫引天行的古代战士穿越时空,来到了塞博特恩。引天行声称只有一种叫“Planet Force 行星之力”的东西可以拯救塞博特恩。“行星之力”是由创造宇宙的元始天尊的火种制造,它们有着具有巨大的威力。运用这种力量,就可以摧毁黑洞,恢复所有被吞噬的星球。为了争夺这些上古圣物,两派争端再起。随着4个藏有行星之力的星球逐步被发现,原来越多风格各异的变形金刚卷了进来。烈焰擎天柱、火线擎天柱、守护擎天柱
《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历,人类正式开始进出宇宙2世纪,但因为2次大型陨石的坠下,人们的生活还是维持在21世纪初。到了新西历179年,第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋的マーケサズ群岛海面。地球连邦政府经过调查,发现是由人类未知的技术制造的物体,这种地球以外的技术被称为EOT(Extra over technology)。地球连邦政府组成了“EOT特别审议会”和“EOTI机关”进行调查。然后EOTI机关的代表比安博士发表了研究结果,表示地球有被宇宙以外的生命体侵略的危机。从此,